Агрономический факультет функционирует со дня образования института. За этот период прошло 58 выпусков агрономов и 4 выпуска ученых агрономов экологов. В свое время факультетом руководили деканы: Казарцев Василий Иванович - 1944-1945 гг.; Квитко Василий Ефимович - 1945-1950 гг., 1956-1960 гг.; Кушев Валерьян Леонтьевич - 1950-1952 гг.; Сакаев Шамиль Хайретдинович - 1952-1953 гг.; Старосельский Игорь Юлианович - 1953-1956 гг.; Алпатова Ксения Васильевна - 1960-1961 гг.; Вершинин Андрей Константинович - 1961-1964 гг.; Оксак Петр Петрович -1964-1967 гг.; Левитин Хаим Залманович - 1967-1968 гг.; Сикорский Игорь Антонович - 1968-1972 гг.; Павлов Виктор Дмитриевич - 1972-1973 гг.; Тарасов Леонид Иванович - 1973-1976 гг.; Степановских Анатолий Сергеевич - 1976-1986 гг.; Голощапов Анатолий Павлович - 1986-1989 гг.; Кокин Геннадий Андреевич 1989-2008 гг.; Горбунов Михаил Юрьевич с 2008 г. по настоящее время.
В настоящее время на факультете обучается около 400 студентов по двум специальностям: 110201 - Агрономия и 320400 - Агроэкология. Кроме того открыты новые направления подготовки бакалавров: Агрохимия и агропочвоведение, Экология и природопользование, Землеустройство и кадастры, Садоводство. Профессорско-преподавательский состав имеет высокую квалификацию. На факультете работает 9 профессоров и докторов наук, 20 доцентов и кандидатов наук, то есть 70 % преподавателей имеют ученые степени и звания.
Выпускники факультета работают на сельскохозяйственных предприятиях, в государственных и научно-исследовательских учреждениях, служат офицерами Российской Армии, таможенных комитетах, работают по охране природы, в экологической милиции, в инспекциях по контролю за качеством семян, в карантинных службах, на станциях по защите растений, в предприятиях по переработке растениеводческой продукции и многих других организациях.
Подготовка специалистов осуществляется на хорошей материальной базе. Кафедры факультета имеют специализированные лаборатории для проведения занятий по всем дисциплинам, входящим в ГОС по специальностям. Лаборатории оснащены современным лабораторным оборудованием производства Чехословакии, Венгрии, Польши, Германии. Всего факультет располагает 24 специализированными лабораториями. На кафедре имеются лаборатории для выполнения научно-исследовательских работ аспирантами и сотрудниками. Аудиторный фонд факультета достаточен для проведения занятий в одну смену. На каждой кафедре и в деканате имеются компьютеры, которые используются для обработки экспериментального материала. Однако введение в образовательные стандарты новых предметов, конечно же, требует приобретения дополнительного оборудования, что и осуществляется по мере необходимости и финансовых возможностей.
Учебные и учебно-научные практики на факультете проводятся на ботаническом участке, госсортоучастке, опытном поле и учебном полигоне, материальная база которых в достаточной степени обеспечивает успешное проведение этих практик. В связи с активизацией компьютерной подготовки студентов большая нагрузка ложится на сотрудников кафедры вычислительной техники и информатики, а также на кафедру экологии и защиты растений, при которой работает компьютерный класс факультета.
В научной работе на всех кафедрах факультета принимают участие преподаватели, аспиранты и студенты. Результаты исследований публикуются в центральных журналах, сборниках научных работ, докладываются на зональных и региональных конференциях, оформляются в докторские, кандидатские и выпускные квалификационные работы. На факультете работает совет по защите кандидатских диссертаций по специальностям: "Защита растений", "Растениеводство", "Земледелие".
На кафедре земледелия разрабатываются элементы адаптивно-ландшафтной системы земледелия Курганской области. Под руководством завкафедрой доцента Исаенко В. А. ведется большая учебно-методическая работа. Коллектив кафедры агрохимии и почвоведения работает над вопросами сохранения плодородия полей Зауралья и создания новых систем удобрений для выращивания экологически чистой сельскохозяйственной продукции. Сотрудники этих кафедр принимали активное участие в исследованиях по системе "Маяк".
Самая крупная на факультете кафедра экологии и защиты растений, возглавляемая доктором сельскохозяйственных наук, заслуженным деятелем науки, профессором Степановских А. С., работает над проблемой зараженности почв и водоемов тяжелыми металлами. По вопросам защиты растений от болезней и вредителей на этой кафедре защищено 3 кандидатских диссертации. Коллектив кафедры вносит большой вклад в подготовку специалистов по агроэкологии.
Коллектив кафедры растениеводства ведет активную работу по совершенствованию технологий выращивания яровых и озимых культур, масличных культур, а так же корнеплодов в условиях Курганской области. На кафедре ботаники и кормопроизводства ведется работа по внедрению энергосберегающих технологий выращивания кормовых культур на силос, сенаж, зерносмеси, фуражное зерно. Сотрудники кафедры селекции и семеноводства исследуют вопросы сортовой агротехники и совершенствования технологий посева сельскохозяйственных культур. В настоящее время на кафедрах факультета обучаются и успешно ведут исследования 11 аспирантов. Коллектив факультета много внимания уделяет учебно-методической работе. За два последних года издано 8 учебно-методических пособий с грифом УМО.
Кроме обучения и научных исследований, студенты факультета принимают активное участие в общественной жизни академии. Для этого в их распоряжении имеются спортивные залы, стадион, дворец культуры. В целом на факультете имеется всё для подготовки высококвалифицированных специалистов, но назревают и проблемы. Основная проблема - недостаточное финансирование научных разработок и обновления библиотечного фонда. Особенно остро стоит вопрос обновления машинного парка опытного поля, необходимы значительные средства для приобретения современных сельскохозяйственных машин. Требуется совершенствовать методику проведения производственной практики студентов в современных условиях.
